Plataforma de Metabolòmica

  • PRESENTACIÓ
  • SERVEIS
  • EQUIPAMENT
  • TARIFES
  • MEMBRES DE L'EQUIP
  • CONTACTE

La Plataforma de Metabolòmica és una infraestructura científica i tecnològica conjunta creada l’any 2007 per proporcionar suport tecnològic i científic avançat en metabolòmica. Opera dins l’ecosistema de MIL@b – Metabolomics Interdisciplinary Laboratory i està integrada al CIBERDEM, la Universitat Rovira i Virgili i l’IRB CatSud.

La metabolòmica és l’estudi integral del metaboloma, és a dir, el conjunt complet de petites molècules presents en un sistema biològic, mitjançant tecnologies analítiques d’alt rendiment. Aquesta disciplina permet caracteritzar fenotips metabòlics i facilita aplicacions en la descoberta de biomarcadors, l’estudi dels mecanismes de malaltia i la medicina de precisió.

La missió de la Plataforma és actuar com un laboratori integrat que dona suport a tot el flux de treball metabolòmic, des del disseny experimental fins a la interpretació biològica. Dona servei a usuaris acadèmics, clínics i industrials i contribueix a la recerca translacional en àmbits com les malalties metabòliques, el càncer i la biologia de sistemes.

 

Estructura

Nodes

La Plataforma està organitzada en dos nodes complementaris:

Node Tarragona

1.MIL@b – Metabolomics Interdisciplinary Laboratory; Escola d’Enginyeria (DEEEA) de la Universitat Rovira i Virgili.

Àmbit principal d’activitat: metabolòmica computacional i desenvolupament tecnològic.

2. Servei de Recursos Científics i Tècnics (SRCiT) a la Universitat Rovira i Virgili.

Àmbit principal d’activitat: preparació i processament de mostres i anàlisis instrumentals.

Node Reus

3. IRB CatSud (Hospital Universitari Sant Joan de Reus)

Àmbit principal d’activitat: processament i anàlisi de dades, identificació de metabòlits, anàlisi estadística, elaboració d’informes, metabolòmica clínica i recerca translacional.

Aquesta estructura de doble node garanteix la integració entre el desenvolupament tecnològic i computacional, la generació i el processament de dades en brut i la seva aplicació biomèdica.

Més informació:

https://www.ciberdem.org/

 

Amb el suport de:

La Plataforma ofereix serveis integrals de metabolòmica adaptats a les necessitats de recerca i assistència clínica.

Serveis científics

  • Disseny experimental i assessorament.
  • Anàlisi metabolòmica dirigida i no dirigida.
  • Lipidòmica i fluxos de treball especialitzats.
  • Processament de dades, anotació i anàlisi estadística.
  • Integració multiómica i enfocaments de biologia de sistemes.
  • Interpretació biològica i elaboració d’informes.

Serveis tecnològics

  • Desenvolupament de mètodes analítics personalitzats.
  • Accés a programari propietari i de codi obert, així com a plataformes al núvol.
  • Anàlisi de dades basada en aprenentatge automàtic i intel·ligència artificial.

Formació i col·laboració

  • Cursos de formació i tallers.
  • Suport en sol·licituds de finançament competitiu i projectes col·laboratius.
  • Integració en xarxes de recerca nacionals i internacionals.

The Platform provides access to state-of-the-art analytical and computational resources, including:

Mass spectrometry systems

  1. 1. LC-MS/MS:
  • – Orbitrap ID-X Tribrid MS for untargeted metabolomics.
  • – Xevo TQ Absolute XR Triple Quadrupole MS for targeted analysis.

 

  1. 2. MALDI Mass Spectrometry Imaging (Spatial Metabolomics)
  • – Exploris 120 Orbitrap MS with Spectroglyph MALDI source.
  • – Matrix deposition by Low-Temperature Thermal Evaporation (LTE) (J Am Soc Mass Spectrom. 2025)

 

  1. 3. DESI Mass Spectrometry Imaging
  • – DESI XS source coupled to Xevo TQ Absolute XR

 

  1. 4. GC-MS:
  • – TRACE 1310 GC coupled to Orbitrap Exactive GC.

 

  1. 5. Nuclear Magnetic Resonance
  • – 600 MHz Bruker Avance III NMR spectrometer

 

  1. 6. Computational Infrastructure
  • – High-performance computing systems
  • – Advanced bioinformatics pipelines: MS2Xplorer, rMSI2
  • – Open source in-house & community-based software: ChemEmbed (Briefings in Bioinformatics, 2026), SingleFrag (Briefings in Bioinformatics, 2025), HERMES (Nature Methods, 2021), CliqueMS (Bioinformatics, 2019), XCMS (version 4), SIRIUS, MSBuddy, etc.
  • – Cloud-based metabolomics analysis platforms: https://datoma.cloud/

These resources enable large-scale, high-resolution analysis of biological samples and complex datasets.

La Plataforma opera sota un model flexible de prestació de serveis, amb preus adaptats segons:

  • – El tipus de servei (analític, computacional o de consultoria).
  • – La complexitat del projecte.
  • – El nombre de mostres.
  • – L’ús acadèmic o industrial.

Les tarifes dels serveis d’espectrometria de masses segueixen els preus anuals aprovats per la Universitat Rovira i Virgili.

Els pressupostos detallats per als serveis computacionals i bioinformàtics s’elaboren a petició per garantir l’alineament amb els objectius específics de cada projecte, d’acord amb els preus aprovats per l’IRB CatSud:

 

La Plataforma està liderada per un equip interdisciplinari d’investigadors i especialistes tècnics que combinen experiència en química, bioquímica, enginyeria, espectrometria de masses i biologia computacional.

  • Coordinador científic: Oscar Yanes, PhD
  • Científic de dades: Jordi Capellades, PhD
  • Tècnica d’espectrometria de masses: Sònia Abelló
  • Tècnica d’espectrometria de masses: Sandra Junza

Hospital Universitari Sant Joan de Reus
Planta 0. Secció de Color Taronja
Avda. Josep Laporte, 4
43204 Reus

Escola Tècnica Superior d’Enginyeria (ETSE) URV
Dept. Eng. Electrònica, Elèctrica i Automàtica
Avinguda Països Catalans 26 43007 Tarragona

Contacte: Óscar Yanes

A/E: metabolomica@irbcatsud.cat
Tel.: +0034 977 759 397 / 977 770 958